兒科呼吸病專業建立于1978年，經過孫薈琴、林慈、李鴻仁、吳鳳寶和張靈恩教授的努力，呼吸專業有了很大的發展。目前學科帶頭人為王立波主任醫生，呼吸專科有22名專科醫生，其中4名主任醫生，6名副主任醫生和8名主治醫生。專科醫生中博士學歷有7名，碩士學歷有12名，其中1名博士生導師，4名碩士生導師，具有完善的醫療和科研人才梯隊。本專業側重解決小兒呼吸道疾病的臨床診斷、治療和預防工作，重癥疑難及罕見兒童肺部疾病診治是學科發展的重點方向。
呼吸病專業有統一管理的呼吸病專業病區、呼吸專科門診(包括兒童哮喘、慢性肺病專病門診)，并配有纖維支氣管鏡室、肺功能室(包括常規肺功能、嬰幼兒肺功能、嬰幼兒體描、支氣管激發試驗、呼出氣NO)、呼吸睡眠異常診斷中心、霧化治療室及特異性免疫治療室。借助于本院的輔助檢查平臺，能夠對患兒進行免疫學、變態反應、病原學及病理學等方面檢查，除了解決兒科常見病，如支氣管哮喘、慢性咳嗽、反復呼吸道感染等的診斷、規范化治療和臨床指導外，重點解決兒童重癥疑難和罕見肺部疾病的診治。
呼吸專業除了承擔醫療工作外，還需要進行醫療教育及科學研究工作；教學工作包括本科生、全英文、8年制學生、規培生、專科規培、進修醫生、研究生及呼吸道疾病高級研修班等。近5年共獲得19項課題研究基金項目，包括6項國家自然科學基金，發表論文30余篇，其中SCI論文10余篇。研究主要涉及兒童肺的早期發育以及發育異常的病理基礎，嬰幼兒呼吸道過敏的形成機制以及早期防治。
專科特色
1. 重癥疑難及罕見肺部疾病的診治：
難治性重癥支原體肺炎及閉塞性支氣管炎(單側透明肺)的早期診斷與治療
重癥腺病毒肺炎及閉塞性細支氣管炎防治
嬰兒吸入性肺炎的診斷與臨床處理
新生兒支氣管肺發育不良的隨訪治療
肺出血的鑒別診斷及特發性肺含鐵血黃素沉積癥的診治
彌漫性間質性肺病的基因診斷與生育指導
彌漫性小氣道分泌物潴積類疾病的診斷(彌漫性泛細支氣管炎、肺囊性纖維化及纖毛不動綜合征)的診斷與處理
2. 常見呼吸道疾病的規范治療
兒童支氣管哮喘的規范治療
慢性咳嗽的病因診斷與治療
嬰幼兒喘息性疾病的診治
反復呼吸道感染的診治
3. 呼吸科臨床新技術應用
纖維支氣管鏡及介入技術：包括三級及四級支氣管鏡技術，可以進行氣道狹窄的球囊擴張、取異物、活檢、冷凍或激光技術等
CT引導下經皮肺穿刺與胸腔鏡下肺組織活檢技術
同位素唾液吸入技術與吸入性肺炎診斷
疑難肺部疾病的基因診斷技術
彌漫性肺出血病因分析與介入治療
高速顯微鏡檢查技術
鼻部及支氣管纖毛的電鏡檢查技術
鼻部NO檢測技術
汗液氯離子檢測技術
