臨床主要用于治療胃炎、胃潰瘍、腹瀉等病癥。

1.胃炎：香砂六君子湯加減治療慢性萎縮性胃炎患者31例，與摩羅丹治療組31例患者對照，療程為3個月。臨床療效評價以癥狀體征消失、食欲正常、胃鏡示胃黏膜慢性炎癥好轉為痊愈標準。結果：總有效率治療組為93.54%，對照組為61.29%;胃鏡示觀察組19例患者胃黏膜恢復正常或有所恢復，對照組19例患者胃黏膜恢復正常或有所恢復;幽門螺旋桿菌檢查治療組15例轉陰，對照組7例轉陰。(《中藥藥理與臨床》2014年第6期)

2.胃潰瘍：香砂六君子湯加味治療胃潰瘍患者60例，與西藥(硫糖鋁、鹽酸雷尼替丁、阿莫西林、甲硝唑)治療組60例患者對照，療程為4周。臨床療效評價以胃鏡檢查潰瘍面愈合，局部沒有明顯紅腫，癥狀基本消失為治愈標準。結果：總有效率治療組為85%，對照組為63.33%。對兩組患者進行為期半年的隨訪，治療組復發4例，由于對照組復發15例。(《中國中醫急癥》2014年第4期)

3.胃下垂：香砂六君子湯加減治療胃下垂患者74例，療程為2個月。臨床療效評價以患者自覺癥狀緩解，X線鋇餐透視檢查顯示胃小彎切跡位于髂嵴連線以上為治愈。結果：74例患者中治愈30例，好轉35例，無效9例，總有效率為87.8%。治愈的30例患者其病程均為2年以內;治療無效的9例患者，其中8例病程在5年以上，1例為病程2年，但胃下垂癥狀嚴重。(《新疆中醫藥》2014年第6期)

4.腹瀉：香砂六君子湯加減聯合補液、對癥支持療法治療小兒腹瀉患者20例，與單純補液、對癥支持治療患者20例對照，療程為1周。臨床療效評價以大便成形，每日1~2次，全身癥狀消失、進食正常為治愈標準。結果：總有效率治療組為90%，對照組為75%。(《湖南中醫雜志》2014年第8期)

5.腸易激綜合征：本方治療腸易激綜合征患者36例，與西藥[地西泮(安定)、普魯苯辛、多潘立酮(嗎丁啉)]治療組21例患者對照，療程為2周。臨床療效評價以主要癥狀和體征基本消失為顯效。結果：總有效率治療組為97.2%，對照組為76.2%。(《湖北中醫雜志》2002年第8期)